提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
华星闪耀2023"云联欢"******
中新网北京2月4日电(戴晨)北京时间2月5日15:00,“四海同春”2023全球华侨华人新春云联欢(以下简称“云联欢”)将正式面向全球开播。在本届“云联欢”中,多个海外华星艺术团及不同行业、不同年龄的华侨华人们将为观众奉上精彩绝伦的演出。
创意短片《中国年世界味》将展现华侨华人在国外过春节的感受,贴春联、包饺子、舞龙舞狮等多种年俗活动让他们找回了记忆中的年味,也体会到了家乡的温暖,无论离家多久、多远,生活在世界各地的华侨华人都依然延续着中国的春节传统习俗。
《中国年世界味》节目截图兔年春节期间,多个海外华星艺术团举办了各种各样的线上线下庆祝活动。《四海同春·华星闪耀》将集中展示这些活动的盛况。身着传统服饰的人们翩翩起舞,跳出属于中华文化的独特魅力。青年们展示的中国武术沉稳有力,一招一式都精准到位,可见其扎实的功底。搭配的歌曲《美美与共》则是采用了现代的电子风格音乐,体现了中外文化的交流融合,唱响华侨华人们对祖(籍)国的热爱。
《四海同春·华星闪耀》节目截图人气歌手李昕融也将亮相“云联欢”,并携手十余所华文学校的师生、悉尼华星艺术团等合唱歌曲《把未来点亮》。华裔青少年是海外华社的希望所在,他们正在青春的赛道上奋力奔跑,充满热情,未来可期。此次,他们将呈现什么样的舞台?让我们拭目以待。
《把未来点亮》节目截图龙腾狮舞庆元宵,华夏儿女同欢笑。“四海同春”2023全球华侨华人新春云联欢将与大家共度佳节!(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |